MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 41104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015562	ATT	2	6	138541	138546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910026
3002	NC_015562	AAT	2	6	138559	138564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910026
3003	NC_015562	TTG	2	6	138666	138671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910026
3004	NC_015562	AT	3	6	138692	138697	50 %	50 %	0 %	0 %	333910026
3005	NC_015562	TTG	2	6	138698	138703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910026
3006	NC_015562	CAT	2	6	138723	138728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910026
3007	NC_015562	T	7	7	138762	138768	0 %	100 %	0 %	0 %	333910026
3008	NC_015562	AG	3	6	138775	138780	50 %	0 %	50 %	0 %	333910026
3009	NC_015562	T	6	6	138791	138796	0 %	100 %	0 %	0 %	333910026
3010	NC_015562	TTCC	2	8	138804	138811	0 %	50 %	0 %	50 %	333910026
3011	NC_015562	CTTCCT	2	12	138852	138863	0 %	50 %	0 %	50 %	333910026
3012	NC_015562	AT	3	6	138899	138904	50 %	50 %	0 %	0 %	333910026
3013	NC_015562	TCCTCA	2	12	138992	139003	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333910026
3014	NC_015562	CCTAAA	2	12	139034	139045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333910026
3015	NC_015562	TTC	2	6	139066	139071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910026
3016	NC_015562	CATAA	2	10	139138	139147	60 %	20 %	0 %	20 %	333910026
3017	NC_015562	CAT	2	6	139164	139169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910026
3018	NC_015562	TCA	2	6	139170	139175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910026
3019	NC_015562	TCCCT	2	10	139185	139194	0 %	40 %	0 %	60 %	333910026
3020	NC_015562	AAC	2	6	139228	139233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910026
3021	NC_015562	ATT	2	6	139352	139357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910026
3022	NC_015562	ATT	2	6	139400	139405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910026
3023	NC_015562	ATT	2	6	139436	139441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910026
3024	NC_015562	AAT	2	6	139459	139464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910026
3025	NC_015562	ATA	2	6	139487	139492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910026
3026	NC_015562	A	6	6	140180	140185	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3027	NC_015562	ATT	2	6	140213	140218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910027
3028	NC_015562	ACA	2	6	140267	140272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910027
3029	NC_015562	GGAA	2	8	140373	140380	50 %	0 %	50 %	0 %	333910027
3030	NC_015562	ATAAA	2	10	140442	140451	80 %	20 %	0 %	0 %	333910027
3031	NC_015562	A	6	6	140461	140466	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3032	NC_015562	AAC	2	6	140468	140473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910027
3033	NC_015562	AAG	2	6	140478	140483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910027
3034	NC_015562	GTT	2	6	140495	140500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910027
3035	NC_015562	TCC	2	6	140522	140527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910027
3036	NC_015562	ATA	2	6	140528	140533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910027
3037	NC_015562	GATTA	2	10	140602	140611	40 %	40 %	20 %	0 %	333910027
3038	NC_015562	A	6	6	140614	140619	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3039	NC_015562	GTT	2	6	140626	140631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910027
3040	NC_015562	AGGATG	2	12	140658	140669	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333910027
3041	NC_015562	TAA	2	6	140673	140678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910027
3042	NC_015562	AAT	2	6	140767	140772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910027
3043	NC_015562	ACT	2	6	140778	140783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910027
3044	NC_015562	TGA	2	6	140797	140802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910027
3045	NC_015562	A	7	7	140822	140828	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3046	NC_015562	A	7	7	140833	140839	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3047	NC_015562	A	6	6	140851	140856	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3048	NC_015562	TAA	2	6	140895	140900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910027
3049	NC_015562	ACT	2	6	140925	140930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910027
3050	NC_015562	A	7	7	140944	140950	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3051	NC_015562	GAT	2	6	141028	141033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910027
3052	NC_015562	ACT	2	6	141113	141118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910027
3053	NC_015562	A	6	6	141138	141143	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3054	NC_015562	GAA	2	6	141156	141161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910027
3055	NC_015562	A	6	6	141160	141165	100 %	0 %	0 %	0 %	333910027
3056	NC_015562	AACAT	2	10	141186	141195	60 %	20 %	0 %	20 %	333910027
3057	NC_015562	TGTTGG	2	12	141244	141255	0 %	50 %	50 %	0 %	333910027
3058	NC_015562	AAATA	2	10	141389	141398	80 %	20 %	0 %	0 %	333910028
3059	NC_015562	AAGTT	2	10	141422	141431	40 %	40 %	20 %	0 %	333910028
3060	NC_015562	CTT	2	6	141517	141522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910028
3061	NC_015562	TTG	2	6	141542	141547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910028
3062	NC_015562	AGTGGA	2	12	141574	141585	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333910028
3063	NC_015562	CAT	2	6	141625	141630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910028
3064	NC_015562	CTTA	2	8	141665	141672	25 %	50 %	0 %	25 %	333910028
3065	NC_015562	CAT	2	6	141674	141679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910028
3066	NC_015562	GGA	2	6	141709	141714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910028
3067	NC_015562	T	6	6	141724	141729	0 %	100 %	0 %	0 %	333910028
3068	NC_015562	GGA	2	6	141730	141735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910028
3069	NC_015562	ATT	2	6	141741	141746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910028
3070	NC_015562	AATTA	2	10	141750	141759	60 %	40 %	0 %	0 %	333910028
3071	NC_015562	AT	3	6	141773	141778	50 %	50 %	0 %	0 %	333910028
3072	NC_015562	ATG	2	6	141818	141823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910028
3073	NC_015562	TAT	2	6	141828	141833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910028
3074	NC_015562	GGA	2	6	141919	141924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910028
3075	NC_015562	AT	4	8	141961	141968	50 %	50 %	0 %	0 %	333910028
3076	NC_015562	AAG	2	6	141975	141980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910028
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3078	NC_015562	TA	3	6	142012	142017	50 %	50 %	0 %	0 %	333910028
3079	NC_015562	A	7	7	142023	142029	100 %	0 %	0 %	0 %	333910028
3080	NC_015562	TTC	2	6	142064	142069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910029
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3082	NC_015562	T	6	6	142093	142098	0 %	100 %	0 %	0 %	333910029
3083	NC_015562	CTCC	2	8	142205	142212	0 %	25 %	0 %	75 %	333910029
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3085	NC_015562	GTT	2	6	142256	142261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910029
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3088	NC_015562	ATC	2	6	142326	142331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910029
3089	NC_015562	T	6	6	142343	142348	0 %	100 %	0 %	0 %	333910029
3090	NC_015562	TCA	2	6	142356	142361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910029
3091	NC_015562	TGT	2	6	142391	142396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910029
3092	NC_015562	TGT	2	6	142416	142421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910029
3093	NC_015562	ATAAC	2	10	142458	142467	60 %	20 %	0 %	20 %	333910029
3094	NC_015562	TCC	2	6	142471	142476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910029
3095	NC_015562	ACT	2	6	142512	142517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910029
3096	NC_015562	T	6	6	142522	142527	0 %	100 %	0 %	0 %	333910029
3097	NC_015562	TCA	2	6	142536	142541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910029
3098	NC_015562	ATAA	2	8	142571	142578	75 %	25 %	0 %	0 %	333910029
3099	NC_015562	TCA	2	6	142593	142598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910029
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3102	NC_015562	AGGA	2	8	142789	142796	50 %	0 %	50 %	0 %	333910029
3103	NC_015562	TAT	2	6	142826	142831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910029
3104	NC_015562	TGA	2	6	142832	142837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910029
3105	NC_015562	TTA	3	9	142873	142881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910029
3106	NC_015562	TAT	2	6	142882	142887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910029
3107	NC_015562	T	6	6	142933	142938	0 %	100 %	0 %	0 %	333910029
3108	NC_015562	CTGT	2	8	142962	142969	0 %	50 %	25 %	25 %	333910029
3109	NC_015562	GCAT	2	8	143003	143010	25 %	25 %	25 %	25 %	333910029
3110	NC_015562	ATGA	2	8	143057	143064	50 %	25 %	25 %	0 %	333910029
3111	NC_015562	TC	3	6	143078	143083	0 %	50 %	0 %	50 %	333910029
3112	NC_015562	CT	3	6	143142	143147	0 %	50 %	0 %	50 %	333910029
3113	NC_015562	A	6	6	143467	143472	100 %	0 %	0 %	0 %	333910030
3114	NC_015562	AGA	2	6	143490	143495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910030
3115	NC_015562	AG	3	6	143514	143519	50 %	0 %	50 %	0 %	333910030
3116	NC_015562	AG	3	6	143562	143567	50 %	0 %	50 %	0 %	333910030
3117	NC_015562	TAG	2	6	143571	143576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910030
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3119	NC_015562	TGG	2	6	143673	143678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910030
3120	NC_015562	GCA	2	6	143794	143799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910030
3121	NC_015562	A	6	6	143811	143816	100 %	0 %	0 %	0 %	333910030
3122	NC_015562	CAA	2	6	143969	143974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910030
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3124	NC_015562	AAAG	2	8	144024	144031	75 %	0 %	25 %	0 %	333910030
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3499	NC_015562	ATA	2	6	160882	160887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910048
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